(RJDBC) R 프로그램으로 오라클(oracle db) 접속하기

앞서 docker 로 오라클 db 를 구축해놨는데, R 프로그램으로 오라클에 접속해본다. 여러가지 방법이 있긴한데.. jdbc driver 를 사용하는게 그나마 간단하게 접속할 수 있었다. 여러가지 방법이 있긴하다. 성능까지 비교한 글이 있어 참고하면 좋을 듯 하다. 

https://blogs.oracle.com/r/r-to-oracle-database-connectivity%3a-use-roracle-for-both-performance-and-scalability-2018

R to Oracle Database Connectivity: Use ROracle for both Performance and Scalability (2018)

 

우선 RJDBC 라이브러리를 활용하기로 했으니, jdbc 다운로드 하러 오라클 웹페이지를 가자.

https://www.oracle.com/database/technologies/appdev/jdbc-downloads.html

JDBC and UCP Downloads page

 

ojdbc8.jar 파일을 받는다. 나중에 R 프로그램에서 읽을 수 있도록 경로만 대략 기억하고,

 

마지막으로, java jdk 가 필요한데, 난 아래 링크에서 java jdk 13 맥용으로 다운받았다. 

https://jdk.java.net/13/

JDK 13.0.2 GA Release

다운받아서 압축을 풀고, /Library/Java/JavaVirtualMachines/ 경로에 붙여 넣는다.

 

R studio 를 열고, RJDBC 를 로드하려 하는데, 오류가 발생한다.

> library(RJDBC)
Loading required package: DBI
Loading required package: rJava
Error: package or namespace load failed for ‘rJava’:
 .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
  call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
  error: unable to load shared object '/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.6/Resources/library/rJava/libs/rJava.so':
  dlopen(/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.6/Resources/library/rJava/libs/rJava.so, 6): Library not loaded: /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk-11.0.1.jdk/Contents/Home/lib/server/libjvm.dylib
  Referenced from: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.6/Resources/library/rJava/libs/rJava.so
  Reason: image not found
Error: package ‘rJava’ could not be loaded

 

rJava 에서 찾는 jdk 경로가 이상하다. 11버전이 있지도 않은데, 왜 저런 경로를 찾아서 library가 로드도 못하는지.. 열심히 구글링 해서 아래 2개 링크를 찾았다. 맥에서 주로 발생하는 문제같은데, 아래 명령어로 수정이 되었다. 

(참고) https://github.com/s-u/rJava/issues/151#issuecomment-395070694
(참고) https://yunhwankim2.github.io/2019/09/25/rstudio-rjava/

install_name_tool -change \
/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk-11.0.1.jdk/Contents/Home/lib/server/libjvm.dylib \
/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk-13.0.2.jdk/Contents/Home/lib/server/libjvm.dylib \
/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.6/Resources/library/rJava/libs/rJava.so

 

docker 로 oracle db 를 run 한다. 이전글을 참고한다.

 

이제 R 프로그램으로 오라클db 와 연결한다.

library(RJDBC)
jdbc_driver = JDBC("oracle.jdbc.OracleDriver", classPath = "../docker/oracle/18.4.0/r/ojdbc8.jar")
con = dbConnect(jdbc_driver, "jdbc:oracle:thin:@//localhost:1521/xepdb1", "sys as sysdba", "1")

 

아래 쿼리의 결과가 R studio 에 표시된다.

> dbGetQuery(con, 'select * from hr.jobs')
       JOB_ID                       JOB_TITLE MIN_SALARY MAX_SALARY
1     AD_PRES                       President      20080      40000
2       AD_VP   Administration Vice President      15000      30000
3     AD_ASST        Administration Assistant       3000       6000
4      FI_MGR                 Finance Manager       8200      16000
5  FI_ACCOUNT                      Accountant       4200       9000
6      AC_MGR              Accounting Manager       8200      16000
7  AC_ACCOUNT               Public Accountant       4200       9000
8      SA_MAN                   Sales Manager      10000      20080
9      SA_REP            Sales Representative       6000      12008
10     PU_MAN              Purchasing Manager       8000      15000
11   PU_CLERK                Purchasing Clerk       2500       5500
12     ST_MAN                   Stock Manager       5500       8500
13   ST_CLERK                     Stock Clerk       2008       5000
14   SH_CLERK                  Shipping Clerk       2500       5500
15    IT_PROG                      Programmer       4000      10000
16     MK_MAN               Marketing Manager       9000      15000
17     MK_REP        Marketing Representative       4000       9000
18     HR_REP  Human Resources Representative       4000       9000
19     PR_REP Public Relations Representative       4500      10500

 

다 사용했다면, 커넥션을 끊는다. 

> dbDisconnect(con)
[1] TRUE